Air Moldova n'est officiellement créée qu'en 1993 par le Président du pays. Elle devient ensuite membre de l'IATA et l'OACI. Les vols de la compagnie transportent à hauteur de 50 % des citoyens moldaves. Depuis 2004, les passagers peuvent faire partie du Air Moldova Club, et bénéficier d'avantages sur les billets d'avion. La compagnie propose régulièrement des promotions sur les vols, dans le souhait continu de faire croître son réseau et ses lignes. La flotte d’Air Moldova se compose d'Airbus A320 et A319 et d'Embraer 190. La compagnie propose une trentaine de destinations de façon régulière et ce en classe économique et business, principalement en Europe. Air Moldova opère aussi des vols charters à destination de la Monténégro, de la Grèce et de la Turquie.